Akademi Perikanan Sidoarjo berdiri setelah terbentuknya Departemen Eksplorasi Laut dan Perikanan yang diubah menjadi Departemen Kelautan dan Perikanan

Sebelum terbentuknya Departemen Kelautan dan perikanan, APS merupakan UPT yang berada dibawah lingkup Departemen Pertanian yang awalnya bernama Sekolah Usaha Perikanan Menengah (SUPM). (Surat Keputusan Menteri Pertanian Nomor: OT.210/415/kpts/6/1983).

Pendidikan dan Pelatihan Ahli Penyuluhan Pertanian (Diklat APP) Malang, Surat Keputusan Menteri Pertanian Nomor: 129/kpts/OT.210/2/93. Akademi Perikanan Sidoarjo (APS) (Keputusan Menteri Eksplorasi Laut dan Perikanan Nomor: 76 Tahun 2000) yang dirubah menjadi (Keputusan Menteri Kelautan dan Perikanan Nomor: Kep.55/MEN/2002).